Персональный компьютер рабочего места оператора работает под управлением ОС Windows. В качестве среды разработки программных алгоритмов, реализуемых в МИИК, используется графический язык программирования LabVIEW.
Прикладное программное обеспечение МИИК осуществляет измерения по разработанным алгоритмам с минимальным вмешательством оператора. ППО принимает, обрабатывает, хранит данные и взаимодействует с другими информационными системами, осуществляет самодиагностику элементов МИИК и предоставляет возможность создавать собственные алгоритмы обработки и анализа данных.
Измерения производятся в режиме реального времени, что позволяет использовать МИИК в промышленности, в том числе на удаленном расстоянии.